Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPI3

Lcor, Ligand-dependent corepressor, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorQ6ZPI3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LcorQ6ZPI3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms