Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms