Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q477

Atp2b4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b4Q6Q477 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp2b4Q6Q477 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp2b4Q6Q477 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp2b4Q6Q477 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp2b4Q6Q477 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp2b4Q6Q477 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp2b4Q6Q477 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp2b4Q6Q477 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp2b4Q6Q477 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp2b4Q6Q477 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp2b4Q6Q477 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp2b4Q6Q477 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp2b4Q6Q477 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp2b4Q6Q477 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp2b4Q6Q477 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp2b4Q6Q477 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp2b4Q6Q477 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp2b4Q6Q477 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp2b4Q6Q477 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp2b4Q6Q477 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp2b4Q6Q477 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp2b4Q6Q477 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp2b4Q6Q477 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp2b4Q6Q477 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp2b4Q6Q477 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp2b4Q6Q477 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp2b4Q6Q477 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp2b4Q6Q477 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp2b4Q6Q477 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp2b4Q6Q477 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp2b4Q6Q477 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp2b4Q6Q477 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp2b4Q6Q477 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp2b4Q6Q477 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp2b4Q6Q477 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp2b4Q6Q477 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp2b4Q6Q477 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp2b4Q6Q477 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp2b4Q6Q477 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp2b4Q6Q477 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp2b4Q6Q477 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp2b4Q6Q477 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp2b4Q6Q477 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp2b4Q6Q477 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp2b4Q6Q477 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp2b4Q6Q477 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp2b4Q6Q477 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp2b4Q6Q477 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp2b4Q6Q477 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp2b4Q6Q477 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp2b4Q6Q477 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp2b4Q6Q477 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp2b4Q6Q477 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp2b4Q6Q477 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp2b4Q6Q477 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp2b4Q6Q477 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp2b4Q6Q477 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp2b4Q6Q477 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp2b4Q6Q477 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp2b4Q6Q477 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp2b4Q6Q477 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp2b4Q6Q477 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp2b4Q6Q477 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp2b4Q6Q477 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp2b4Q6Q477 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp2b4Q6Q477 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp2b4Q6Q477 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp2b4Q6Q477 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp2b4Q6Q477 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp2b4Q6Q477 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp2b4Q6Q477 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp2b4Q6Q477 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp2b4Q6Q477 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp2b4Q6Q477 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp2b4Q6Q477 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp2b4Q6Q477 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Atp2b4Q6Q477 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Atp2b4Q6Q477 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp2b4Q6Q477 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp2b4Q6Q477 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp2b4Q6Q477 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp2b4Q6Q477 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp2b4Q6Q477 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp2b4Q6Q477 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp2b4Q6Q477 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp2b4Q6Q477 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2b4Q6Q477 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2b4Q6Q477 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2b4Q6Q477 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2b4Q6Q477 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2b4Q6Q477 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2b4Q6Q477 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2b4Q6Q477 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2b4Q6Q477 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2b4Q6Q477 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2b4Q6Q477 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp2b4Q6Q477 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp2b4Q6Q477 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp2b4Q6Q477 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp2b4Q6Q477 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms