Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scaf4Q6PFF0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scaf4Q6PFF0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scaf4Q6PFF0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Scaf4Q6PFF0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scaf4Q6PFF0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scaf4Q6PFF0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scaf4Q6PFF0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scaf4Q6PFF0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scaf4Q6PFF0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scaf4Q6PFF0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scaf4Q6PFF0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scaf4Q6PFF0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scaf4Q6PFF0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scaf4Q6PFF0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scaf4Q6PFF0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scaf4Q6PFF0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scaf4Q6PFF0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scaf4Q6PFF0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scaf4Q6PFF0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Scaf4Q6PFF0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scaf4Q6PFF0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scaf4Q6PFF0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scaf4Q6PFF0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scaf4Q6PFF0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scaf4Q6PFF0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scaf4Q6PFF0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scaf4Q6PFF0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scaf4Q6PFF0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scaf4Q6PFF0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scaf4Q6PFF0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scaf4Q6PFF0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scaf4Q6PFF0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scaf4Q6PFF0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scaf4Q6PFF0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scaf4Q6PFF0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scaf4Q6PFF0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scaf4Q6PFF0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scaf4Q6PFF0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scaf4Q6PFF0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scaf4Q6PFF0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scaf4Q6PFF0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scaf4Q6PFF0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Scaf4Q6PFF0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scaf4Q6PFF0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scaf4Q6PFF0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scaf4Q6PFF0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms