Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK8

Dtx4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx4Q6PDK8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dtx4Q6PDK8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms