Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC0

Rundc3b, RUN domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3bQ6PDC0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rundc3bQ6PDC0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rundc3bQ6PDC0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rundc3bQ6PDC0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rundc3bQ6PDC0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rundc3bQ6PDC0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rundc3bQ6PDC0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rundc3bQ6PDC0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rundc3bQ6PDC0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rundc3bQ6PDC0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rundc3bQ6PDC0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rundc3bQ6PDC0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms