Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZR2

Msantd2, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msantd2Q6NZR2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Msantd2Q6NZR2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Msantd2Q6NZR2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Msantd2Q6NZR2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Msantd2Q6NZR2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Msantd2Q6NZR2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Msantd2Q6NZR2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Msantd2Q6NZR2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Msantd2Q6NZR2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Msantd2Q6NZR2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Msantd2Q6NZR2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Msantd2Q6NZR2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Msantd2Q6NZR2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Msantd2Q6NZR2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Msantd2Q6NZR2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Msantd2Q6NZR2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Msantd2Q6NZR2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Msantd2Q6NZR2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Msantd2Q6NZR2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Msantd2Q6NZR2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Msantd2Q6NZR2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Msantd2Q6NZR2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms