Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms