Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg16l2Q6KAU8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg16l2Q6KAU8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg16l2Q6KAU8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg16l2Q6KAU8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg16l2Q6KAU8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg16l2Q6KAU8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg16l2Q6KAU8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg16l2Q6KAU8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg16l2Q6KAU8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg16l2Q6KAU8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg16l2Q6KAU8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg16l2Q6KAU8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg16l2Q6KAU8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg16l2Q6KAU8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg16l2Q6KAU8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg16l2Q6KAU8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg16l2Q6KAU8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg16l2Q6KAU8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg16l2Q6KAU8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg16l2Q6KAU8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg16l2Q6KAU8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg16l2Q6KAU8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg16l2Q6KAU8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg16l2Q6KAU8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg16l2Q6KAU8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg16l2Q6KAU8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg16l2Q6KAU8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg16l2Q6KAU8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg16l2Q6KAU8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg16l2Q6KAU8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg16l2Q6KAU8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg16l2Q6KAU8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg16l2Q6KAU8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg16l2Q6KAU8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg16l2Q6KAU8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg16l2Q6KAU8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg16l2Q6KAU8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg16l2Q6KAU8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg16l2Q6KAU8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg16l2Q6KAU8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg16l2Q6KAU8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms