Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms