Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms