Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV12

Kdsr, 3-ketodihydrosphingosine reductase, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdsrQ6GV12 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KdsrQ6GV12 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KdsrQ6GV12 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KdsrQ6GV12 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KdsrQ6GV12 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KdsrQ6GV12 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KdsrQ6GV12 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KdsrQ6GV12 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KdsrQ6GV12 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KdsrQ6GV12 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KdsrQ6GV12 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KdsrQ6GV12 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KdsrQ6GV12 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KdsrQ6GV12 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KdsrQ6GV12 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KdsrQ6GV12 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KdsrQ6GV12 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KdsrQ6GV12 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KdsrQ6GV12 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KdsrQ6GV12 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KdsrQ6GV12 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KdsrQ6GV12 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KdsrQ6GV12 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KdsrQ6GV12 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KdsrQ6GV12 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KdsrQ6GV12 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KdsrQ6GV12 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KdsrQ6GV12 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KdsrQ6GV12 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KdsrQ6GV12 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KdsrQ6GV12 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KdsrQ6GV12 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KdsrQ6GV12 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KdsrQ6GV12 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KdsrQ6GV12 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms