Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nop58Q6DFW4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nop58Q6DFW4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nop58Q6DFW4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nop58Q6DFW4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nop58Q6DFW4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nop58Q6DFW4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nop58Q6DFW4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nop58Q6DFW4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nop58Q6DFW4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nop58Q6DFW4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nop58Q6DFW4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nop58Q6DFW4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nop58Q6DFW4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nop58Q6DFW4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nop58Q6DFW4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nop58Q6DFW4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nop58Q6DFW4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Nop58Q6DFW4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nop58Q6DFW4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nop58Q6DFW4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nop58Q6DFW4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Nop58Q6DFW4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nop58Q6DFW4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Nop58Q6DFW4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Nop58Q6DFW4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nop58Q6DFW4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Nop58Q6DFW4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nop58Q6DFW4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nop58Q6DFW4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nop58Q6DFW4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nop58Q6DFW4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nop58Q6DFW4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nop58Q6DFW4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nop58Q6DFW4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nop58Q6DFW4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Nop58Q6DFW4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nop58Q6DFW4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nop58Q6DFW4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Nop58Q6DFW4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nop58Q6DFW4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nop58Q6DFW4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nop58Q6DFW4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nop58Q6DFW4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nop58Q6DFW4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nop58Q6DFW4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nop58Q6DFW4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nop58Q6DFW4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nop58Q6DFW4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nop58Q6DFW4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nop58Q6DFW4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nop58Q6DFW4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nop58Q6DFW4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Nop58Q6DFW4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nop58Q6DFW4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nop58Q6DFW4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nop58Q6DFW4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Nop58Q6DFW4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nop58Q6DFW4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nop58Q6DFW4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nop58Q6DFW4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nop58Q6DFW4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nop58Q6DFW4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nop58Q6DFW4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nop58Q6DFW4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nop58Q6DFW4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Nop58Q6DFW4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nop58Q6DFW4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nop58Q6DFW4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nop58Q6DFW4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nop58Q6DFW4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nop58Q6DFW4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nop58Q6DFW4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Nop58Q6DFW4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nop58Q6DFW4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nop58Q6DFW4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nop58Q6DFW4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nop58Q6DFW4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nop58Q6DFW4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nop58Q6DFW4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nop58Q6DFW4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Nop58Q6DFW4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Nop58Q6DFW4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Nop58Q6DFW4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nop58Q6DFW4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nop58Q6DFW4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nop58Q6DFW4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nop58Q6DFW4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Nop58Q6DFW4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nop58Q6DFW4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nop58Q6DFW4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nop58Q6DFW4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nop58Q6DFW4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nop58Q6DFW4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nop58Q6DFW4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nop58Q6DFW4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nop58Q6DFW4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nop58Q6DFW4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nop58Q6DFW4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nop58Q6DFW4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms