Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q6DFW0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q6DFW0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q6DFW0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q6DFW0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q6DFW0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Q6DFW0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q6DFW0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q6DFW0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q6DFW0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q6DFW0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q6DFW0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q6DFW0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q6DFW0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q6DFW0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Q6DFW0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q6DFW0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q6DFW0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q6DFW0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q6DFW0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q6DFW0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q6DFW0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q6DFW0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q6DFW0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q6DFW0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q6DFW0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q6DFW0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q6DFW0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q6DFW0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q6DFW0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q6DFW0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q6DFW0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q6DFW0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q6DFW0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q6DFW0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q6DFW0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q6DFW0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q6DFW0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Q6DFW0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Q6DFW0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Q6DFW0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Q6DFW0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Q6DFW0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Q6DFW0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6DFW0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6DFW0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q6DFW0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q6DFW0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q6DFW0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms