Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdzrn3Q69ZS0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdzrn3Q69ZS0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdzrn3Q69ZS0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdzrn3Q69ZS0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdzrn3Q69ZS0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdzrn3Q69ZS0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdzrn3Q69ZS0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdzrn3Q69ZS0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdzrn3Q69ZS0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdzrn3Q69ZS0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdzrn3Q69ZS0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdzrn3Q69ZS0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdzrn3Q69ZS0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdzrn3Q69ZS0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdzrn3Q69ZS0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdzrn3Q69ZS0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdzrn3Q69ZS0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdzrn3Q69ZS0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdzrn3Q69ZS0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdzrn3Q69ZS0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdzrn3Q69ZS0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pdzrn3Q69ZS0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pdzrn3Q69ZS0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pdzrn3Q69ZS0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pdzrn3Q69ZS0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pdzrn3Q69ZS0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pdzrn3Q69ZS0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pdzrn3Q69ZS0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pdzrn3Q69ZS0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pdzrn3Q69ZS0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pdzrn3Q69ZS0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pdzrn3Q69ZS0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pdzrn3Q69ZS0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdzrn3Q69ZS0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdzrn3Q69ZS0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdzrn3Q69ZS0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdzrn3Q69ZS0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdzrn3Q69ZS0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdzrn3Q69ZS0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdzrn3Q69ZS0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdzrn3Q69ZS0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdzrn3Q69ZS0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdzrn3Q69ZS0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdzrn3Q69ZS0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdzrn3Q69ZS0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdzrn3Q69ZS0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdzrn3Q69ZS0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdzrn3Q69ZS0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdzrn3Q69ZS0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdzrn3Q69ZS0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdzrn3Q69ZS0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdzrn3Q69ZS0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdzrn3Q69ZS0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdzrn3Q69ZS0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdzrn3Q69ZS0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdzrn3Q69ZS0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdzrn3Q69ZS0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdzrn3Q69ZS0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdzrn3Q69ZS0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdzrn3Q69ZS0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdzrn3Q69ZS0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdzrn3Q69ZS0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdzrn3Q69ZS0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdzrn3Q69ZS0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdzrn3Q69ZS0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdzrn3Q69ZS0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdzrn3Q69ZS0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdzrn3Q69ZS0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdzrn3Q69ZS0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdzrn3Q69ZS0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdzrn3Q69ZS0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdzrn3Q69ZS0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdzrn3Q69ZS0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdzrn3Q69ZS0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms