Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB8

Zcchc2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc2Q69ZB8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zcchc2Q69ZB8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zcchc2Q69ZB8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zcchc2Q69ZB8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zcchc2Q69ZB8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zcchc2Q69ZB8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zcchc2Q69ZB8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zcchc2Q69ZB8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zcchc2Q69ZB8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zcchc2Q69ZB8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zcchc2Q69ZB8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zcchc2Q69ZB8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zcchc2Q69ZB8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zcchc2Q69ZB8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zcchc2Q69ZB8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zcchc2Q69ZB8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zcchc2Q69ZB8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zcchc2Q69ZB8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zcchc2Q69ZB8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zcchc2Q69ZB8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zcchc2Q69ZB8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zcchc2Q69ZB8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zcchc2Q69ZB8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zcchc2Q69ZB8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zcchc2Q69ZB8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zcchc2Q69ZB8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zcchc2Q69ZB8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zcchc2Q69ZB8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zcchc2Q69ZB8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zcchc2Q69ZB8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zcchc2Q69ZB8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zcchc2Q69ZB8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zcchc2Q69ZB8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zcchc2Q69ZB8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zcchc2Q69ZB8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zcchc2Q69ZB8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zcchc2Q69ZB8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zcchc2Q69ZB8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zcchc2Q69ZB8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Zcchc2Q69ZB8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zcchc2Q69ZB8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zcchc2Q69ZB8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zcchc2Q69ZB8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zcchc2Q69ZB8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zcchc2Q69ZB8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zcchc2Q69ZB8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zcchc2Q69ZB8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zcchc2Q69ZB8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zcchc2Q69ZB8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zcchc2Q69ZB8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zcchc2Q69ZB8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Zcchc2Q69ZB8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zcchc2Q69ZB8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zcchc2Q69ZB8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zcchc2Q69ZB8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zcchc2Q69ZB8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zcchc2Q69ZB8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Zcchc2Q69ZB8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zcchc2Q69ZB8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zcchc2Q69ZB8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zcchc2Q69ZB8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zcchc2Q69ZB8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zcchc2Q69ZB8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms