Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cntn4Q69Z26 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cntn4Q69Z26 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cntn4Q69Z26 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cntn4Q69Z26 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cntn4Q69Z26 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cntn4Q69Z26 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cntn4Q69Z26 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Cntn4Q69Z26 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cntn4Q69Z26 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cntn4Q69Z26 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cntn4Q69Z26 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cntn4Q69Z26 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cntn4Q69Z26 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cntn4Q69Z26 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cntn4Q69Z26 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cntn4Q69Z26 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cntn4Q69Z26 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cntn4Q69Z26 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cntn4Q69Z26 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cntn4Q69Z26 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cntn4Q69Z26 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cntn4Q69Z26 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cntn4Q69Z26 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cntn4Q69Z26 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cntn4Q69Z26 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cntn4Q69Z26 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cntn4Q69Z26 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cntn4Q69Z26 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cntn4Q69Z26 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cntn4Q69Z26 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cntn4Q69Z26 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cntn4Q69Z26 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cntn4Q69Z26 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cntn4Q69Z26 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cntn4Q69Z26 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cntn4Q69Z26 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cntn4Q69Z26 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cntn4Q69Z26 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cntn4Q69Z26 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cntn4Q69Z26 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cntn4Q69Z26 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cntn4Q69Z26 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cntn4Q69Z26 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cntn4Q69Z26 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cntn4Q69Z26 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cntn4Q69Z26 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cntn4Q69Z26 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cntn4Q69Z26 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cntn4Q69Z26 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cntn4Q69Z26 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cntn4Q69Z26 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cntn4Q69Z26 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cntn4Q69Z26 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cntn4Q69Z26 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cntn4Q69Z26 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cntn4Q69Z26 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cntn4Q69Z26 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cntn4Q69Z26 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms