Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CltcQ68FD5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CltcQ68FD5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CltcQ68FD5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CltcQ68FD5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CltcQ68FD5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CltcQ68FD5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CltcQ68FD5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CltcQ68FD5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CltcQ68FD5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CltcQ68FD5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CltcQ68FD5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CltcQ68FD5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CltcQ68FD5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CltcQ68FD5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CltcQ68FD5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CltcQ68FD5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CltcQ68FD5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CltcQ68FD5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CltcQ68FD5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CltcQ68FD5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CltcQ68FD5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CltcQ68FD5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CltcQ68FD5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CltcQ68FD5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CltcQ68FD5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CltcQ68FD5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CltcQ68FD5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CltcQ68FD5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CltcQ68FD5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CltcQ68FD5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CltcQ68FD5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CltcQ68FD5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CltcQ68FD5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CltcQ68FD5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CltcQ68FD5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CltcQ68FD5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CltcQ68FD5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CltcQ68FD5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CltcQ68FD5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CltcQ68FD5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CltcQ68FD5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CltcQ68FD5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CltcQ68FD5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CltcQ68FD5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CltcQ68FD5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CltcQ68FD5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CltcQ68FD5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CltcQ68FD5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CltcQ68FD5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CltcQ68FD5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CltcQ68FD5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CltcQ68FD5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CltcQ68FD5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CltcQ68FD5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CltcQ68FD5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CltcQ68FD5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CltcQ68FD5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CltcQ68FD5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CltcQ68FD5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CltcQ68FD5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CltcQ68FD5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CltcQ68FD5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CltcQ68FD5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CltcQ68FD5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CltcQ68FD5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CltcQ68FD5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CltcQ68FD5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CltcQ68FD5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CltcQ68FD5 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CltcQ68FD5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CltcQ68FD5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CltcQ68FD5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CltcQ68FD5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CltcQ68FD5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CltcQ68FD5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CltcQ68FD5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CltcQ68FD5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CltcQ68FD5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CltcQ68FD5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CltcQ68FD5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CltcQ68FD5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CltcQ68FD5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CltcQ68FD5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CltcQ68FD5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CltcQ68FD5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CltcQ68FD5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CltcQ68FD5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CltcQ68FD5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CltcQ68FD5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CltcQ68FD5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CltcQ68FD5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CltcQ68FD5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CltcQ68FD5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CltcQ68FD5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CltcQ68FD5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CltcQ68FD5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CltcQ68FD5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CltcQ68FD5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CltcQ68FD5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms