Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sbno1Q689Z5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sbno1Q689Z5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sbno1Q689Z5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sbno1Q689Z5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sbno1Q689Z5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sbno1Q689Z5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sbno1Q689Z5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sbno1Q689Z5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sbno1Q689Z5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Sbno1Q689Z5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sbno1Q689Z5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sbno1Q689Z5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sbno1Q689Z5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sbno1Q689Z5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sbno1Q689Z5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sbno1Q689Z5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sbno1Q689Z5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sbno1Q689Z5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sbno1Q689Z5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sbno1Q689Z5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sbno1Q689Z5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sbno1Q689Z5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sbno1Q689Z5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sbno1Q689Z5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sbno1Q689Z5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sbno1Q689Z5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sbno1Q689Z5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sbno1Q689Z5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sbno1Q689Z5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sbno1Q689Z5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sbno1Q689Z5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Sbno1Q689Z5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sbno1Q689Z5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Sbno1Q689Z5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Sbno1Q689Z5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Sbno1Q689Z5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sbno1Q689Z5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sbno1Q689Z5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sbno1Q689Z5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sbno1Q689Z5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sbno1Q689Z5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sbno1Q689Z5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sbno1Q689Z5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sbno1Q689Z5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sbno1Q689Z5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sbno1Q689Z5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sbno1Q689Z5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Sbno1Q689Z5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sbno1Q689Z5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sbno1Q689Z5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sbno1Q689Z5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sbno1Q689Z5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sbno1Q689Z5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sbno1Q689Z5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sbno1Q689Z5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sbno1Q689Z5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sbno1Q689Z5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sbno1Q689Z5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Sbno1Q689Z5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sbno1Q689Z5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sbno1Q689Z5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sbno1Q689Z5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sbno1Q689Z5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sbno1Q689Z5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sbno1Q689Z5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sbno1Q689Z5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sbno1Q689Z5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sbno1Q689Z5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sbno1Q689Z5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sbno1Q689Z5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sbno1Q689Z5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sbno1Q689Z5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sbno1Q689Z5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sbno1Q689Z5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sbno1Q689Z5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sbno1Q689Z5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sbno1Q689Z5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sbno1Q689Z5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sbno1Q689Z5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sbno1Q689Z5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sbno1Q689Z5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sbno1Q689Z5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sbno1Q689Z5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Sbno1Q689Z5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sbno1Q689Z5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sbno1Q689Z5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Sbno1Q689Z5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sbno1Q689Z5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sbno1Q689Z5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sbno1Q689Z5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sbno1Q689Z5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sbno1Q689Z5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sbno1Q689Z5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Sbno1Q689Z5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sbno1Q689Z5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sbno1Q689Z5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sbno1Q689Z5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sbno1Q689Z5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sbno1Q689Z5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms