Protein–RNA interactions for Protein: Q66JV7

Uncharacterized protein C8orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q66JV7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Q66JV7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Q66JV7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q66JV7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q66JV7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q66JV7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q66JV7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q66JV7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q66JV7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q66JV7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q66JV7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q66JV7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q66JV7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q66JV7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q66JV7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q66JV7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q66JV7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q66JV7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q66JV7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q66JV7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q66JV7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q66JV7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q66JV7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Q66JV7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q66JV7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q66JV7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q66JV7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q66JV7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q66JV7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q66JV7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q66JV7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q66JV7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q66JV7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q66JV7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q66JV7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q66JV7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q66JV7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q66JV7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q66JV7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q66JV7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q66JV7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Q66JV7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Q66JV7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q66JV7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Q66JV7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q66JV7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q66JV7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q66JV7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q66JV7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q66JV7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q66JV7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q66JV7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q66JV7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q66JV7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Q66JV7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q66JV7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q66JV7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Q66JV7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q66JV7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q66JV7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q66JV7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q66JV7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q66JV7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Q66JV7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q66JV7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q66JV7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q66JV7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q66JV7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q66JV7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q66JV7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q66JV7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q66JV7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q66JV7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q66JV7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q66JV7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q66JV7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q66JV7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q66JV7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q66JV7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q66JV7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q66JV7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q66JV7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Q66JV7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Q66JV7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q66JV7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q66JV7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q66JV7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q66JV7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q66JV7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q66JV7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q66JV7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q66JV7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q66JV7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q66JV7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q66JV7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q66JV7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q66JV7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q66JV7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q66JV7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q66JV7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms