Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ctnna3Q65CL1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Ctnna3Q65CL1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ctnna3Q65CL1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnna3Q65CL1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnna3Q65CL1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnna3Q65CL1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnna3Q65CL1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnna3Q65CL1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnna3Q65CL1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnna3Q65CL1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnna3Q65CL1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctnna3Q65CL1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctnna3Q65CL1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctnna3Q65CL1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctnna3Q65CL1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctnna3Q65CL1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctnna3Q65CL1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctnna3Q65CL1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctnna3Q65CL1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctnna3Q65CL1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctnna3Q65CL1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctnna3Q65CL1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctnna3Q65CL1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctnna3Q65CL1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctnna3Q65CL1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctnna3Q65CL1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctnna3Q65CL1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctnna3Q65CL1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctnna3Q65CL1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctnna3Q65CL1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctnna3Q65CL1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctnna3Q65CL1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctnna3Q65CL1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctnna3Q65CL1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctnna3Q65CL1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctnna3Q65CL1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctnna3Q65CL1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctnna3Q65CL1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctnna3Q65CL1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctnna3Q65CL1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctnna3Q65CL1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctnna3Q65CL1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctnna3Q65CL1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctnna3Q65CL1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctnna3Q65CL1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctnna3Q65CL1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctnna3Q65CL1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctnna3Q65CL1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctnna3Q65CL1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctnna3Q65CL1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctnna3Q65CL1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctnna3Q65CL1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctnna3Q65CL1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctnna3Q65CL1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctnna3Q65CL1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctnna3Q65CL1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctnna3Q65CL1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctnna3Q65CL1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctnna3Q65CL1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctnna3Q65CL1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctnna3Q65CL1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctnna3Q65CL1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctnna3Q65CL1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctnna3Q65CL1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ctnna3Q65CL1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctnna3Q65CL1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctnna3Q65CL1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctnna3Q65CL1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctnna3Q65CL1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctnna3Q65CL1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctnna3Q65CL1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctnna3Q65CL1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctnna3Q65CL1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctnna3Q65CL1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctnna3Q65CL1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctnna3Q65CL1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ctnna3Q65CL1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ctnna3Q65CL1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ctnna3Q65CL1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ctnna3Q65CL1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ctnna3Q65CL1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ctnna3Q65CL1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ctnna3Q65CL1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ctnna3Q65CL1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctnna3Q65CL1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctnna3Q65CL1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms