Protein–RNA interactions for Protein: Q64705

Usf2, Upstream stimulatory factor 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf2Q64705 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms