Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf1Q64213 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sf1Q64213 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sf1Q64213 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sf1Q64213 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sf1Q64213 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sf1Q64213 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sf1Q64213 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sf1Q64213 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sf1Q64213 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sf1Q64213 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sf1Q64213 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sf1Q64213 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sf1Q64213 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sf1Q64213 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sf1Q64213 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms