Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms