Protein–RNA interactions for Protein: Q62460

Gm20865, (clone BALB3N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20865Q62460 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20865Q62460 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20865Q62460 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20865Q62460 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20865Q62460 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20865Q62460 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20865Q62460 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20865Q62460 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20865Q62460 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20865Q62460 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20865Q62460 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20865Q62460 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20865Q62460 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20865Q62460 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20865Q62460 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20865Q62460 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20865Q62460 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20865Q62460 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20865Q62460 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms