Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sp4Q62445 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sp4Q62445 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sp4Q62445 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sp4Q62445 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sp4Q62445 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sp4Q62445 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sp4Q62445 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sp4Q62445 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sp4Q62445 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sp4Q62445 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sp4Q62445 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sp4Q62445 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Sp4Q62445 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sp4Q62445 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sp4Q62445 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sp4Q62445 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sp4Q62445 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sp4Q62445 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sp4Q62445 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sp4Q62445 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sp4Q62445 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sp4Q62445 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sp4Q62445 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sp4Q62445 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sp4Q62445 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sp4Q62445 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sp4Q62445 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sp4Q62445 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Sp4Q62445 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Sp4Q62445 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sp4Q62445 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sp4Q62445 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sp4Q62445 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sp4Q62445 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Sp4Q62445 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sp4Q62445 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sp4Q62445 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sp4Q62445 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sp4Q62445 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sp4Q62445 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sp4Q62445 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sp4Q62445 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sp4Q62445 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sp4Q62445 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sp4Q62445 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sp4Q62445 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sp4Q62445 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sp4Q62445 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sp4Q62445 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sp4Q62445 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sp4Q62445 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sp4Q62445 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sp4Q62445 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sp4Q62445 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sp4Q62445 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sp4Q62445 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sp4Q62445 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sp4Q62445 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms