Protein–RNA interactions for Protein: Q62413

Epha6, Ephrin type-A receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha6Q62413 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms