Protein–RNA interactions for Protein: Q62395

Tff3, Trefoil factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff3Q62395 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms