Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim28Q62318 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim28Q62318 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim28Q62318 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim28Q62318 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim28Q62318 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim28Q62318 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim28Q62318 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim28Q62318 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim28Q62318 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim28Q62318 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim28Q62318 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim28Q62318 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim28Q62318 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim28Q62318 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim28Q62318 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim28Q62318 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim28Q62318 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim28Q62318 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim28Q62318 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim28Q62318 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim28Q62318 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim28Q62318 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim28Q62318 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim28Q62318 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim28Q62318 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim28Q62318 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim28Q62318 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim28Q62318 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim28Q62318 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim28Q62318 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim28Q62318 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim28Q62318 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim28Q62318 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim28Q62318 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim28Q62318 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim28Q62318 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim28Q62318 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim28Q62318 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim28Q62318 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim28Q62318 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim28Q62318 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim28Q62318 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim28Q62318 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim28Q62318 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim28Q62318 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim28Q62318 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trim28Q62318 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trim28Q62318 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim28Q62318 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim28Q62318 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim28Q62318 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim28Q62318 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim28Q62318 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim28Q62318 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim28Q62318 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim28Q62318 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim28Q62318 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim28Q62318 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim28Q62318 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim28Q62318 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim28Q62318 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim28Q62318 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim28Q62318 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim28Q62318 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim28Q62318 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim28Q62318 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim28Q62318 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim28Q62318 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim28Q62318 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim28Q62318 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim28Q62318 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim28Q62318 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim28Q62318 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim28Q62318 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim28Q62318 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim28Q62318 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim28Q62318 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim28Q62318 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim28Q62318 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim28Q62318 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim28Q62318 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim28Q62318 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim28Q62318 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim28Q62318 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim28Q62318 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim28Q62318 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim28Q62318 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim28Q62318 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim28Q62318 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim28Q62318 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim28Q62318 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim28Q62318 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim28Q62318 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim28Q62318 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim28Q62318 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim28Q62318 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim28Q62318 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trim28Q62318 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim28Q62318 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim28Q62318 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
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