Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Kdm5dQ62240 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Kdm5dQ62240 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
Kdm5dQ62240 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
Kdm5dQ62240 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Kdm5dQ62240 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Kdm5dQ62240 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Kdm5dQ62240 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Kdm5dQ62240 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Kdm5dQ62240 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Kdm5dQ62240 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Kdm5dQ62240 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Kdm5dQ62240 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Kdm5dQ62240 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Kdm5dQ62240 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Kdm5dQ62240 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Kdm5dQ62240 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Kdm5dQ62240 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Kdm5dQ62240 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Kdm5dQ62240 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Kdm5dQ62240 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Kdm5dQ62240 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
Kdm5dQ62240 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
Kdm5dQ62240 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Kdm5dQ62240 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Kdm5dQ62240 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Kdm5dQ62240 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Kdm5dQ62240 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Kdm5dQ62240 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Kdm5dQ62240 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Kdm5dQ62240 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Kdm5dQ62240 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Kdm5dQ62240 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Kdm5dQ62240 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Kdm5dQ62240 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Kdm5dQ62240 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Kdm5dQ62240 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Kdm5dQ62240 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Kdm5dQ62240 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Kdm5dQ62240 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Kdm5dQ62240 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Kdm5dQ62240 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
Kdm5dQ62240 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Kdm5dQ62240 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Kdm5dQ62240 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Kdm5dQ62240 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Kdm5dQ62240 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Kdm5dQ62240 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Kdm5dQ62240 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Kdm5dQ62240 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Kdm5dQ62240 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Kdm5dQ62240 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Kdm5dQ62240 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Kdm5dQ62240 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Kdm5dQ62240 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Kdm5dQ62240 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Kdm5dQ62240 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Kdm5dQ62240 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Kdm5dQ62240 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Kdm5dQ62240 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
Kdm5dQ62240 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
Kdm5dQ62240 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Kdm5dQ62240 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Kdm5dQ62240 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Kdm5dQ62240 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
Kdm5dQ62240 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Kdm5dQ62240 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Kdm5dQ62240 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Kdm5dQ62240 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Kdm5dQ62240 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Kdm5dQ62240 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Kdm5dQ62240 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
Kdm5dQ62240 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Kdm5dQ62240 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Kdm5dQ62240 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Kdm5dQ62240 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Kdm5dQ62240 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Kdm5dQ62240 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Kdm5dQ62240 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Kdm5dQ62240 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Kdm5dQ62240 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Kdm5dQ62240 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Kdm5dQ62240 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
Kdm5dQ62240 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Kdm5dQ62240 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
Kdm5dQ62240 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Kdm5dQ62240 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Kdm5dQ62240 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Kdm5dQ62240 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
Kdm5dQ62240 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Kdm5dQ62240 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
Kdm5dQ62240 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Kdm5dQ62240 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Kdm5dQ62240 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Kdm5dQ62240 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Kdm5dQ62240 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Kdm5dQ62240 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Kdm5dQ62240 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Kdm5dQ62240 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Kdm5dQ62240 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms