Protein–RNA interactions for Protein: Q62205

Scn9a, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn9aQ62205 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scn9aQ62205 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scn9aQ62205 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn9aQ62205 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn9aQ62205 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn9aQ62205 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn9aQ62205 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn9aQ62205 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn9aQ62205 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn9aQ62205 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn9aQ62205 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn9aQ62205 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn9aQ62205 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn9aQ62205 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn9aQ62205 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn9aQ62205 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn9aQ62205 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn9aQ62205 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scn9aQ62205 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scn9aQ62205 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scn9aQ62205 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Scn9aQ62205 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scn9aQ62205 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Scn9aQ62205 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scn9aQ62205 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scn9aQ62205 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scn9aQ62205 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Scn9aQ62205 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Scn9aQ62205 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scn9aQ62205 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scn9aQ62205 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scn9aQ62205 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scn9aQ62205 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scn9aQ62205 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scn9aQ62205 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scn9aQ62205 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scn9aQ62205 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scn9aQ62205 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scn9aQ62205 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scn9aQ62205 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scn9aQ62205 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scn9aQ62205 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scn9aQ62205 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scn9aQ62205 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scn9aQ62205 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scn9aQ62205 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scn9aQ62205 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scn9aQ62205 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scn9aQ62205 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scn9aQ62205 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scn9aQ62205 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scn9aQ62205 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scn9aQ62205 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scn9aQ62205 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn9aQ62205 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn9aQ62205 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn9aQ62205 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn9aQ62205 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn9aQ62205 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn9aQ62205 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn9aQ62205 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn9aQ62205 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn9aQ62205 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn9aQ62205 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn9aQ62205 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn9aQ62205 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn9aQ62205 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn9aQ62205 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scn9aQ62205 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scn9aQ62205 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scn9aQ62205 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn9aQ62205 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn9aQ62205 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn9aQ62205 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn9aQ62205 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn9aQ62205 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn9aQ62205 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn9aQ62205 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn9aQ62205 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn9aQ62205 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scn9aQ62205 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scn9aQ62205 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scn9aQ62205 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scn9aQ62205 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scn9aQ62205 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scn9aQ62205 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scn9aQ62205 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Scn9aQ62205 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Scn9aQ62205 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Scn9aQ62205 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms