Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SnrpaQ62189 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SnrpaQ62189 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SnrpaQ62189 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SnrpaQ62189 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SnrpaQ62189 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SnrpaQ62189 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SnrpaQ62189 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SnrpaQ62189 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SnrpaQ62189 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SnrpaQ62189 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SnrpaQ62189 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SnrpaQ62189 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SnrpaQ62189 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SnrpaQ62189 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SnrpaQ62189 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SnrpaQ62189 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SnrpaQ62189 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SnrpaQ62189 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SnrpaQ62189 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms