Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttf1Q62187 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttf1Q62187 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttf1Q62187 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttf1Q62187 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttf1Q62187 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttf1Q62187 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttf1Q62187 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttf1Q62187 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttf1Q62187 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttf1Q62187 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttf1Q62187 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttf1Q62187 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttf1Q62187 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttf1Q62187 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttf1Q62187 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Ttf1Q62187 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttf1Q62187 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttf1Q62187 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttf1Q62187 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttf1Q62187 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttf1Q62187 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttf1Q62187 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttf1Q62187 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttf1Q62187 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttf1Q62187 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttf1Q62187 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttf1Q62187 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttf1Q62187 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttf1Q62187 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttf1Q62187 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttf1Q62187 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttf1Q62187 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttf1Q62187 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttf1Q62187 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Ttf1Q62187 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttf1Q62187 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttf1Q62187 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Ttf1Q62187 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttf1Q62187 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttf1Q62187 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttf1Q62187 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttf1Q62187 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttf1Q62187 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttf1Q62187 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
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Ttf1Q62187 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttf1Q62187 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Ttf1Q62187 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttf1Q62187 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Ttf1Q62187 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ttf1Q62187 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttf1Q62187 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttf1Q62187 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttf1Q62187 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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Ttf1Q62187 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttf1Q62187 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttf1Q62187 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Ttf1Q62187 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttf1Q62187 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttf1Q62187 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Ttf1Q62187 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttf1Q62187 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttf1Q62187 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttf1Q62187 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttf1Q62187 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttf1Q62187 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttf1Q62187 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttf1Q62187 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttf1Q62187 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttf1Q62187 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttf1Q62187 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttf1Q62187 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttf1Q62187 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttf1Q62187 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttf1Q62187 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttf1Q62187 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttf1Q62187 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Ttf1Q62187 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttf1Q62187 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 196.2 ms