Protein–RNA interactions for Protein: Q62158

Trim27, Zinc finger protein RFP, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim27Q62158 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim27Q62158 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim27Q62158 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim27Q62158 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim27Q62158 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim27Q62158 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim27Q62158 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim27Q62158 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim27Q62158 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim27Q62158 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim27Q62158 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim27Q62158 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim27Q62158 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim27Q62158 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim27Q62158 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim27Q62158 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim27Q62158 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim27Q62158 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim27Q62158 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim27Q62158 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim27Q62158 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim27Q62158 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim27Q62158 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim27Q62158 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim27Q62158 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim27Q62158 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim27Q62158 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim27Q62158 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim27Q62158 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim27Q62158 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim27Q62158 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim27Q62158 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim27Q62158 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim27Q62158 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim27Q62158 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim27Q62158 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim27Q62158 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim27Q62158 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms