Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctr9Q62018 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctr9Q62018 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctr9Q62018 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctr9Q62018 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctr9Q62018 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctr9Q62018 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctr9Q62018 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctr9Q62018 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctr9Q62018 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctr9Q62018 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctr9Q62018 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctr9Q62018 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctr9Q62018 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctr9Q62018 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctr9Q62018 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctr9Q62018 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctr9Q62018 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctr9Q62018 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctr9Q62018 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctr9Q62018 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctr9Q62018 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctr9Q62018 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctr9Q62018 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctr9Q62018 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctr9Q62018 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctr9Q62018 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctr9Q62018 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctr9Q62018 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctr9Q62018 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctr9Q62018 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctr9Q62018 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctr9Q62018 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctr9Q62018 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctr9Q62018 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctr9Q62018 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctr9Q62018 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ctr9Q62018 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ctr9Q62018 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms