Protein–RNA interactions for Protein: Q61990

Pcbp2, Poly(rC)-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp2Q61990 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pcbp2Q61990 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pcbp2Q61990 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pcbp2Q61990 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pcbp2Q61990 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pcbp2Q61990 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pcbp2Q61990 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pcbp2Q61990 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pcbp2Q61990 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pcbp2Q61990 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pcbp2Q61990 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pcbp2Q61990 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pcbp2Q61990 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pcbp2Q61990 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pcbp2Q61990 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pcbp2Q61990 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcbp2Q61990 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcbp2Q61990 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcbp2Q61990 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcbp2Q61990 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcbp2Q61990 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcbp2Q61990 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcbp2Q61990 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcbp2Q61990 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcbp2Q61990 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcbp2Q61990 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcbp2Q61990 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcbp2Q61990 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pcbp2Q61990 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pcbp2Q61990 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pcbp2Q61990 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pcbp2Q61990 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pcbp2Q61990 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pcbp2Q61990 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pcbp2Q61990 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pcbp2Q61990 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pcbp2Q61990 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pcbp2Q61990 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pcbp2Q61990 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pcbp2Q61990 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pcbp2Q61990 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Pcbp2Q61990 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pcbp2Q61990 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pcbp2Q61990 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pcbp2Q61990 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pcbp2Q61990 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pcbp2Q61990 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pcbp2Q61990 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pcbp2Q61990 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pcbp2Q61990 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Pcbp2Q61990 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pcbp2Q61990 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pcbp2Q61990 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Pcbp2Q61990 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pcbp2Q61990 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pcbp2Q61990 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pcbp2Q61990 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pcbp2Q61990 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pcbp2Q61990 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pcbp2Q61990 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcbp2Q61990 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcbp2Q61990 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcbp2Q61990 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcbp2Q61990 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcbp2Q61990 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcbp2Q61990 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcbp2Q61990 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcbp2Q61990 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcbp2Q61990 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcbp2Q61990 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcbp2Q61990 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcbp2Q61990 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcbp2Q61990 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcbp2Q61990 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcbp2Q61990 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcbp2Q61990 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcbp2Q61990 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcbp2Q61990 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcbp2Q61990 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcbp2Q61990 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcbp2Q61990 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcbp2Q61990 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcbp2Q61990 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcbp2Q61990 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcbp2Q61990 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcbp2Q61990 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcbp2Q61990 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pcbp2Q61990 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pcbp2Q61990 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pcbp2Q61990 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pcbp2Q61990 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pcbp2Q61990 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pcbp2Q61990 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pcbp2Q61990 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pcbp2Q61990 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pcbp2Q61990 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pcbp2Q61990 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pcbp2Q61990 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pcbp2Q61990 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pcbp2Q61990 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms