Protein–RNA interactions for Protein: Q61897

Krt33b, Keratin, type I cuticular Ha3-II, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33bQ61897 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt33bQ61897 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt33bQ61897 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt33bQ61897 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt33bQ61897 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt33bQ61897 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt33bQ61897 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt33bQ61897 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt33bQ61897 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt33bQ61897 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt33bQ61897 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt33bQ61897 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt33bQ61897 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt33bQ61897 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt33bQ61897 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt33bQ61897 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt33bQ61897 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt33bQ61897 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt33bQ61897 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt33bQ61897 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt33bQ61897 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt33bQ61897 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt33bQ61897 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt33bQ61897 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt33bQ61897 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt33bQ61897 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt33bQ61897 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt33bQ61897 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt33bQ61897 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt33bQ61897 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt33bQ61897 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt33bQ61897 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt33bQ61897 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt33bQ61897 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt33bQ61897 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt33bQ61897 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt33bQ61897 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt33bQ61897 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt33bQ61897 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt33bQ61897 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt33bQ61897 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt33bQ61897 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms