Protein–RNA interactions for Protein: Q61635

Ifi47, GTP-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi47Q61635 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifi47Q61635 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms