Protein–RNA interactions for Protein: Q61476

Cd55b, Complement decay-accelerating factor transmembrane isoform, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd55bQ61476 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd55bQ61476 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cd55bQ61476 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cd55bQ61476 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cd55bQ61476 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd55bQ61476 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd55bQ61476 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd55bQ61476 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd55bQ61476 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd55bQ61476 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd55bQ61476 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd55bQ61476 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd55bQ61476 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd55bQ61476 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd55bQ61476 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd55bQ61476 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd55bQ61476 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd55bQ61476 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd55bQ61476 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd55bQ61476 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd55bQ61476 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd55bQ61476 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd55bQ61476 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd55bQ61476 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd55bQ61476 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd55bQ61476 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd55bQ61476 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd55bQ61476 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd55bQ61476 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd55bQ61476 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd55bQ61476 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd55bQ61476 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd55bQ61476 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms