Protein–RNA interactions for Protein: Q61450

Gp49a, Mast cell surface glycoprotein Gp49A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp49aQ61450 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gp49aQ61450 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gp49aQ61450 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gp49aQ61450 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gp49aQ61450 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gp49aQ61450 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gp49aQ61450 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gp49aQ61450 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gp49aQ61450 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gp49aQ61450 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gp49aQ61450 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gp49aQ61450 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms