Protein–RNA interactions for Protein: Q61286

Tcf12, Transcription factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf12Q61286 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tcf12Q61286 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tcf12Q61286 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tcf12Q61286 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tcf12Q61286 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tcf12Q61286 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tcf12Q61286 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tcf12Q61286 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tcf12Q61286 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tcf12Q61286 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tcf12Q61286 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tcf12Q61286 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tcf12Q61286 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tcf12Q61286 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tcf12Q61286 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tcf12Q61286 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tcf12Q61286 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tcf12Q61286 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tcf12Q61286 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcf12Q61286 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcf12Q61286 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcf12Q61286 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcf12Q61286 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcf12Q61286 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcf12Q61286 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcf12Q61286 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcf12Q61286 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcf12Q61286 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcf12Q61286 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcf12Q61286 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcf12Q61286 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcf12Q61286 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcf12Q61286 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcf12Q61286 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Tcf12Q61286 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Tcf12Q61286 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcf12Q61286 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcf12Q61286 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcf12Q61286 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcf12Q61286 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcf12Q61286 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcf12Q61286 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcf12Q61286 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcf12Q61286 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcf12Q61286 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcf12Q61286 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcf12Q61286 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcf12Q61286 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcf12Q61286 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcf12Q61286 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcf12Q61286 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcf12Q61286 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcf12Q61286 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcf12Q61286 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcf12Q61286 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcf12Q61286 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcf12Q61286 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcf12Q61286 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcf12Q61286 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcf12Q61286 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcf12Q61286 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcf12Q61286 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcf12Q61286 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcf12Q61286 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcf12Q61286 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcf12Q61286 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcf12Q61286 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcf12Q61286 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcf12Q61286 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcf12Q61286 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcf12Q61286 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcf12Q61286 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcf12Q61286 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcf12Q61286 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcf12Q61286 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcf12Q61286 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcf12Q61286 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcf12Q61286 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcf12Q61286 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcf12Q61286 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcf12Q61286 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcf12Q61286 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcf12Q61286 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcf12Q61286 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcf12Q61286 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcf12Q61286 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcf12Q61286 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcf12Q61286 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcf12Q61286 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcf12Q61286 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcf12Q61286 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcf12Q61286 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcf12Q61286 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcf12Q61286 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcf12Q61286 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcf12Q61286 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcf12Q61286 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcf12Q61286 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcf12Q61286 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcf12Q61286 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms