Protein–RNA interactions for Protein: Q61191

Hcfc1, Host cell factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,045 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc1Q61191 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcfc1Q61191 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcfc1Q61191 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcfc1Q61191 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcfc1Q61191 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcfc1Q61191 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcfc1Q61191 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcfc1Q61191 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcfc1Q61191 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcfc1Q61191 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcfc1Q61191 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcfc1Q61191 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcfc1Q61191 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcfc1Q61191 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcfc1Q61191 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcfc1Q61191 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcfc1Q61191 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcfc1Q61191 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hcfc1Q61191 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms