Protein–RNA interactions for Protein: Q61043

Nin, Ninein, mousemouse

Predictions only

Length 2,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinQ61043 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NinQ61043 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NinQ61043 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NinQ61043 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NinQ61043 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NinQ61043 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NinQ61043 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NinQ61043 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NinQ61043 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NinQ61043 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NinQ61043 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NinQ61043 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NinQ61043 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NinQ61043 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NinQ61043 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NinQ61043 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NinQ61043 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NinQ61043 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NinQ61043 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NinQ61043 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NinQ61043 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NinQ61043 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NinQ61043 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NinQ61043 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NinQ61043 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NinQ61043 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NinQ61043 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NinQ61043 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NinQ61043 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NinQ61043 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NinQ61043 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NinQ61043 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NinQ61043 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NinQ61043 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NinQ61043 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NinQ61043 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NinQ61043 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NinQ61043 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NinQ61043 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NinQ61043 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NinQ61043 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NinQ61043 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NinQ61043 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NinQ61043 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NinQ61043 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NinQ61043 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NinQ61043 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NinQ61043 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NinQ61043 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NinQ61043 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NinQ61043 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NinQ61043 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NinQ61043 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NinQ61043 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NinQ61043 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NinQ61043 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NinQ61043 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NinQ61043 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NinQ61043 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NinQ61043 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NinQ61043 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NinQ61043 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NinQ61043 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NinQ61043 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NinQ61043 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NinQ61043 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NinQ61043 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NinQ61043 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NinQ61043 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NinQ61043 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NinQ61043 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NinQ61043 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NinQ61043 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NinQ61043 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NinQ61043 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NinQ61043 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NinQ61043 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NinQ61043 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NinQ61043 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NinQ61043 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NinQ61043 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NinQ61043 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NinQ61043 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NinQ61043 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NinQ61043 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NinQ61043 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NinQ61043 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NinQ61043 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NinQ61043 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NinQ61043 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NinQ61043 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NinQ61043 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NinQ61043 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NinQ61043 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NinQ61043 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NinQ61043 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NinQ61043 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NinQ61043 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NinQ61043 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NinQ61043 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms