Protein–RNA interactions for Protein: Q60987

Foxg1, Forkhead box protein G1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxg1Q60987 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Foxg1Q60987 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms