Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DbpQ60925 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DbpQ60925 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DbpQ60925 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DbpQ60925 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DbpQ60925 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DbpQ60925 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DbpQ60925 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DbpQ60925 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms