Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms