Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms