Protein–RNA interactions for Protein: Q60649

Clpb, Caseinolytic peptidase B protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpbQ60649 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ClpbQ60649 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ClpbQ60649 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ClpbQ60649 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ClpbQ60649 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ClpbQ60649 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ClpbQ60649 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ClpbQ60649 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ClpbQ60649 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ClpbQ60649 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ClpbQ60649 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ClpbQ60649 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ClpbQ60649 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ClpbQ60649 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ClpbQ60649 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ClpbQ60649 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ClpbQ60649 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ClpbQ60649 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ClpbQ60649 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ClpbQ60649 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ClpbQ60649 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ClpbQ60649 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ClpbQ60649 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ClpbQ60649 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ClpbQ60649 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ClpbQ60649 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ClpbQ60649 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ClpbQ60649 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ClpbQ60649 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ClpbQ60649 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ClpbQ60649 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ClpbQ60649 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ClpbQ60649 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ClpbQ60649 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ClpbQ60649 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms