Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms