Protein–RNA interactions for Protein: Q5TIS6

Noto, Homeobox protein notochord, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NotoQ5TIS6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms